Für Ubuntu 14.04 Server bleibt nur, auf einen neueren Apachen umzustellen.
Es gibt da zum Beispiel folgendes Repository: https://launchpad.net/~ondrej/+archive/ubuntu/apache2
Da ist immer die aktuellste Apache-Version hinterlegt. Ob euer Admin das allerdings einbinden möchte, ist fraglich.
Als mein System noch auf Ubuntu 14.04 lief, hatte ich das eingebunden und Seafile lief ohne Probleme damit.
Hier mal ein Link zum ursprünglichen Bug-Report bei Seafile: https://github.com/haiwen/seafile/issues/1258
Was den Fehler in Apache auslöst, kann ich dir nicht sagen. Ich kann bloß sagen, das es mit neueren Versionen von Apache aus dem PPA einwandfrei funktioniert.